Согласно официального версии НБП, Лимонов находился там в творческой командировке (последний год Лимонов регулярно ездит на Алтай). В факсе пресс-службы НБП указано, что задержание Лимонова было проведено в с. Банное, на т.н. «пасеке Пирогова». Алтайские активисты НБП утверждают, что в момент задержания Лимонов находился в Усть-Коксинском районе республики Алтай, известном места паломничества поклонников Рериха. В горной избушке-заимке, где проживал Лимонов, собралось порядка 15 активистов НБП, а том числе член исполкома НБП, учредитель газеты «Лимонка» Сергей Аксенов, а также молодой человек, бывший героем инцидента с киданием тухлого яйца в режиссера Никиту Михалкова.
7 апреля в республику на специальном самолете прибыла группа представителей ФСБ РФ с целью задержания и этапирования Лимонова. По словам очевидцев, в задержании участвовало порядка 100 человек в масках и камуфляже, применявших в ходе задержания спецсредства дубинки и светошумовые гранаты. Руководил операцией офицер в чине полковника. Задержанные были этапированы в Москву, где большая часть из их была отпущена, а Лимонов и Аксенов препровождены в Лефортово.
По некоторым данным, арест Лимонова стал полной неожиданностью для правоохранительных органов и властей маленькой горной республики (за исключением управления ФСБ, задействованного в операции).
Согласно данным пресс-службы НБП, причиной задержания стал анонимный донос, в котором Лимонов и его сподвижники обвинялись в «организации вооруженной преступной группировки». «Сейчас путинские голуби из органов могут упрятать в тюрьму любого», отмечается в заявлении НБП по поводу задержания своего лидера.