Отмечается, что уровень цен на квартиры в столице РА выше, чем в соседних сибирских регионах. Это связано с тем, что до 2002 года строительный комплекс города был буквально заморожен.
Стоит отметить однако, что цифры стоимости вторичного жилья по данным Госкомстата значительно ниже реальных цен рынка. Очевидно, при их определении статистики пользовались как стоимостью квартир в многоэтажных домах, так и стоимостью метра площади в частных домах, многие из которых находятся в ветхом состоянии и достаточно дешевы. Реальная стоимость стандартной однокоматной квартиры в центральных районах Горно-Алтайска составляет порядка 500-530 тыс. рублей. Для сравнения - аналогичная квартира в сравнимых районах Барнаула стоит около 480-500 тыс. рублей.