Попытки незаконного хозяйственного освоения земель заказника «Ая» предпринимались регулярно.

В последние годы неоднократно предпринимались попытки незаконного хозяйственного освоения земель природного заказника «Ая», который должен быть ликвидирован на октябрьской сессии Алтайского крайсовета. Цена земли в этой, наиболее динамично развивающейся туристической зоне Алтайского края, чрезвычайно высока и почти 80 га земель заказника, включающих по данным крайпрокуратуры, ряд островов на Катуни, являются лакомым кусокм для многочисленных застройщиков.

Так, в апреле 2005 г. Генпрокуратура России отмечала, что в ходе проведения проверки прокуратурой края в Арбитражный суд было направлено исковое заявление о признании недействительным договора аренды земельного участка общей площадью 5,5 га, расположенного в водоохранной зоне реки Катунь, представленного в виде лесных участков трех обособленных островов.

Договор был заключен между администрацией Алтайского района и ООО «Зори». Три переданных по оспариваемому договору аренды острова входят в государственный природный заказник краевого значения «Озеро Ая». Они относятся к землям особо охраняемых территорий, в связи с чем, в силу требований Закона Алтайского края «Об особо охраняемых территориях в Алтайском крае», администрация Алтайского района не вправе распоряжаться указанными землями и предоставлять их на праве аренды.

Кроме этого, при заключении договора аренды, не были соблюдены требования федерального законодательства об охране окружающей среды, об экологической экспертизе. Договор был заключен также с нарушением требований Водного Кодекса РФ без согласования с федеральным органом исполнительной власти и охраны водного фонда.

Стоит отметить, что попытка федералов-силовиков защищить земли заказника от хищнического строительства имела в 2005 г. политический оттенок — контролируемое известной в предгорьях Алтая семьей предпринимателей Егонянов ООО «Зори» развернуло на одном из охраняемых островов строительство «замка» — по неофициальной информации, по заказу действовавшего тогда губернатора Михаила Евдокимова. Удалось ли прокуратуре освободить захваченные земли — официальной информации не имеется.

Теперь, после передачи земель заказника в состав одноименного природного парка охранный статус этих земель резко снизится и далее подобные решения едва ли могут оспариваться.

Впрочем, слово «снизится» не вполне корректно — передача в состав существующего без какого-либо положения о своем статусе природного парка понизит охранный статус этой, одной из наиболее неблагополучных экологически территорий, практически до нуля. Об этом заявляла прокуратура края совсем недавно — в июне 2006 г. «До настоящего времени отсутствует положение о созданном в 2003 году природном парке краевого значения «Ая», не приняты такие положения и в отношении памятников природы краевого значения," — с тревогой говорилось в ее заявлении.