Фонд является некоммерческой организацией и осуществляет свою деятельность совместно с Государственным фондом. Учредитель фонда - администрация Алтайского края. Фонд является юридическим лицом, имеет расчетный и иные счета в банках, самостоятельный баланс, круглую печать, штампы и бланки.
Основная задача фонда содействие госполитики в формировании рыночных отношений в научно-технической сфере, создание и развитие инфраструктуры малого инновационного предпринимательства, поощрение конкуренции через привлечение финансовых ресурсов и их целевое эффективное использование для реализации федеральных, отраслевых и региональных программ и проектов по использованию производства наукоемких продуктов.
Возглавляет наблюдательный совет фонда в крае, состоящий из семи человек, Владимир Ступин.