Это государственное учреждение определено головным по выполнению научных исследований в рамках государственной программы по реабилитации населения и социально-экономическому развитию населенных пунктов края, подвергшихся многолетнему радиационному воздействию ядерных взрывов на Семипалатинском полигоне.
Начиная с 1989 года эту проблему исследуют несколько десятков научных учреждений края и страны. Определено, что ядерный след на Алтае оставили 60 ядерных взрывов в соседней Семипалатинской области. По результатам уникальной работы ученых правительство России дважды, в 1992 и 1993 годах принимало соответствующие постановления. В рамках реализации этих документов в крае определены льготы постадавшим от ядерных взрывов, построены и возводятся десятки лечебных учреждений, в том числе диагностический и онкологический центры, проводится большая работа по исследованию взрывов и профилактике заболеваний.
Директором института назначен доктор медицинских наук, профессор Валерий Киселев.