Как сообщил председатель комитета администрации края по транспорту, дорожному хозяйству и связи Николай Долженко, на сегодняшний день в Алтайском крае существует ОАО «Авиакомпания «Алтай», где работают 650 бывших работников БГАП, государственное унитарное предприятие «Алтайские авиалинии», государственное унитарное предприятие «Агентство воздушных сообщений», а также филиал авиакомпании «Сибирь» (Новосибирск), где также работают 77 человек летного состава БГАП. Кроме того в настоящее время решается вопрос о создании авиатехнического центра на базе технических служб БГАП, а также о том, чтобы московская авиакомпания «Полюс» перебазировалась в Барнаул.
По словам Николая Долженко, БГАП в составе 32 сотрудников остается, поскольку вся материальная часть принадлежит ему, а вновь созданные предприятия лишь арендуют у него самолеты, здания и др. БГАП, по свидетельству Долженко, будет существовать до тех пор, пока не рассчитается с долгами, при этом вопрос о долге перед банком «Горный Алтай» является наиболее сложным.