Задачами данного отдела являются обеспечение прокурорского надзора за исполнением государственными органами, органами местного самоуправления, правоохранительными органами края, должностными лицами и руководителями коммерческих и некоммерческих организаций законодательства в сфере противодействия экстремистской деятельности и терроризму, о межнациональных и конфессиональных отношениях.
Ранее Центр по противодействию экстремизму функционировал при ГУВД Алтайского края. Его деятельность постоянно сопровождалась скандалами. В конце июня было принято решение о реформировании Центра "Э". Вместо него создано подразделение ГУВД с аналогичным функционалом, но, по неподтвержденным пока данным, гораздо меньшей численностью штата.